De Association ontstond in 2001 uit een fusie tussen de Confederation of European Union Rectors' Conferences en de Association of European Universities. Vorig jaar zomer al ging het gerucht dat Van Vught de nieuwe voorzitter zou worden van de EUA, `Niets van waar', liet Van Vught toen weten, in reactie op het bericht over zijn beoogde voorzitterschap. Het EUA-bestuur telt negen leden, die aan hun functie geen dagtaak hebben.
De Association zetelt in Brussel, maar is geen onderdeel van het EU-apparaat. Wel is de club een gesprekspartner voor de Europese Commissie en de Europese ministersvergadering. Met haar activiteiten wil de EUA de rol versterken die universiteiten spelen in de opkomende Europese higher education and research areas.
