Hoe kunnen we die eiwitten herkennen en in de gaten houden, die een hoofdrol spelen in auto-immuunziekten? Die vraag wil dr.ir. Richard Schasfoort van de Universiteit Twente beantwoorden door een speciale biochip te ontwikkelen voor de herkenning ervan. Op de chip kunnen vele interacties tussen eiwitten tegelijkertijd worden onderzocht.
De eiwitblauwdruk van de mens geeft nog veel meer informatie dan DNA, over de cel-eigenschappen en over oorzaken van ziekten. Om nu specifiek de eiwitten te vinden die in auto-immuun ziekten een hoofdrol spelen, gaat Schasfoort een geavanceerde biochip ontwikkelen. Dat is een chip waarop het straks mogelijk is om tegelijkertijd veel interacties tussen eiwitten te onderzoeken. Eerder al is de techniek ingezet voor de monitoring van prostaatkanker, waarbij een eiwit herkend kon worden met een nauwkeurigheid van een tiende nanogram per milliliter.
Aan de basis staat Surface Plasmon Resonance Imaging (SPRi), een techniek om eiwitinteracties af te beelden. De chip krijgt een groot aantal gouden oppervlakjes waarop eiwitten zitten die slechts met één ander eiwit kunnen reageren. Het is nu de kunst om de 'targets' te vinden die horen bij de eiwitten die auto-immuunziekten bepalen. Daarvoor is het nodig om heel veel interacties tegelijk te onderzoeken. Doordat alle reacties 'gerangschikt' plaatsvinden, in de matrix van goudoppervlakken, is een snel inzicht te krijgen in de belangrijkste patronen te krijgen, met gebruikmaking van imagingtechnieken.
Een groot deel van de functies is te integreren op de chip, zoals de fysieke scheiding van eiwitten, de SPR imaging en de behandeling van vloeistoffen. Schasfoort verwacht dat het project leidt tot apparatuur die een brede range aan toepassingen kan dienen.
Richard Schasfoort werkt in het nieuwe project samen met de Universiteit Utrecht (Biomedische Analyse en Proteomics/Biomoleculaire Massaspectrometrie) en de Katholieke Universiteit Nijmegen (Biochemie).
